Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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