Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NDUFS4O43181 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NDUFS4O43181 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NDUFS4O43181 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NDUFS4O43181 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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