Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms