Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLGNO14967 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms