Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F3O00716 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F3O00716 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F3O00716 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms