Protein–RNA interactions for Protein: O00585

CCL21, C-C motif chemokine 21, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21O00585 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL21O00585 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL21O00585 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CCL21O00585 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CCL21O00585 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CCL21O00585 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL21O00585 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL21O00585 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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