Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C2AO00443 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms