Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms