Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR3A8MPY1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms