Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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