Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms