Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms