Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms