Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms