Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms