Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms