Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms