Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ELL3Q9HB65 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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