Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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