Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms