Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms