Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms