Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms