Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAF4Q9BUZ4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms