Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM79Q9BSE2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms