Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms