Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms