Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3R4Q99570 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3R4Q99570 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms