Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms