Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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