Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms