Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms