Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms