Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms