Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms