Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF31Q96EP0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms