Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EME1Q96AY2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms