Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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