Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA6DQ8NFY4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA6DQ8NFY4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA6DQ8NFY4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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