Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms