Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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