Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMC1Q7Z7K0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMC1Q7Z7K0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms