Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms