Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms