Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FBXO38Q6PIJ6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FBXO38Q6PIJ6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms