Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC30A6Q6NXT4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms