Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms