Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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