Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms