Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms